När kroppen transporterar blod till hjärtat, pumpar hjärtat syre i blodet. Arterier transporterar sedan det syre-rika blodet till olika områden i kroppen. Den underordnade rektala artären transporterar syresatt blod till den nedre delen av anus och analkanalen. Analkanalen är slutpartiet av tjocktarmen som skjuter avfall in i rektum för utvisning från kroppen.
Artären grenar sig från den inre pudendalartären, som tillför blodflödet till könsorgan som ligger utanför kroppen, såsom penis. Artären grenar sig i tre segment som passerar över benen i bäckenet. Varje gren levererar blod till musklerna i det anala området.
Den underordnade rektala artären levererar syresatt blod till gluteus maximus, som är den största musklerna i mänskliga skinkorna. Artären levererar också blod till skinkan. Artärerna cirklar sedan kroppen och ansluter till blodkärlen i rektum och perineal artär.